Las ventanas se pueden separar de donde están si las arrastramos por su barra hacia el lado contrario al que están pegadas. Así podemos por ejemplo separar la ventana de capas si la arrastramos hacia dentro haciendo clic en su barra y arrastrando sin soltar, claro.
Si hacemos esto o nos ocurre por accidente, podemos volver a poner las ventanas en su sitio con la función Restaurar aspectos esenciales, está un poco escondida pero es muy útil para estos casos.